אבחון זה נערך על ידי פסיכולוגית הממפה את תחומי החוזק והקושי של הילד.
האבחון כולל מערך של מבחנים המעריכים את היכולות הרגשיות והשכליות,כמו גם את מידת הרכישה של המיומנויות והכשרים הדרושים ללמידה תקינה של קריאה , כתיבה וחשבון.
בנוסף לכך קיימת במרכז מערכת אבחון ממוחשבת, הכוללת תוכנה ייחודית להערכת היכולות של הילד ומידת המוכנות שלו לכיתה א'.